Симптомите на системен лупус еритематозус се характеризират с изразен полиморфизъм, но почти 20% от децата имат моноорганни варианти на начало на заболяването. Протичането на системен лупус еритематозус обикновено е вълнообразно, с редуващи се периоди на обостряния и ремисии. Като цяло, системният лупус еритематозус при децата се характеризира с по-остро начало и протичане на заболяването, по-ранна и по-бурна генерализация и по-неблагоприятен изход, отколкото при възрастните.