Клиничната диагноза е надеждна само при лобарна пневмония, но вероятността за пневмококова етиология на придобитата в обществото пневмония, отит, синузит е 60-80°. Диагнозата може да бъде потвърдена само въз основа на резултатите от микробиологичното изследване на съответния биосубстрат: при ринит - секрет от носа (намазка), при отит, синузит - гноен ексудат, при пневмония - храчки, при менингит - цереброспинална течност.