Аномалиите на жлъчните пътища и черния дроб могат да бъдат свързани с други вродени аномалии, включително сърдечни дефекти, полидактилия и поликистозна бъбречна болест. Развитието на аномалии на жлъчните пътища може да бъде свързано с вирусни инфекции при майката, като рубеола.